本次“秘籍重光，百年敦煌”专题文献资料展览分为五个单元：第一单元介绍敦煌的历史地理及人文环境，用多幅照片和实物向人们展示敦煌历史上曾经有过的辉煌。第二单元揭示了“敦煌藏经洞的发现与敦煌遗书的流散”。展品中既有斯坦因、伯希和在敦煌的照片，也有敦煌遗书在运京后被旧官僚监守自盗，将一件撕为数件用以充数的敦煌遗书原件以及他们以假充真而今已炭化了的实物。第三单元展示了“国家图书馆敦煌遗书的收藏与保护”，一批新中国成立以来政府调拨、私家捐赠敦煌遗书的档案首次公布。第四单元里数十件敦煌遗书实物第一次公开展出，内容涉及个人领域和多种文字，如遗书题年、书法艺术、各类文献、书籍装帧、古代印刷等，充分展示出敦煌遗书的绚丽风采。如西凉建初12年（公元417年）的写本《律藏初分》是馆藏敦煌遗书中有确切纪年的最早的一件，历经近1600年仍完好如初；《舞谱》、《摩尼教经典》等已是国内仅存的资料，其珍贵程度不言而喻；另《辨亡论》、《姓氏录》、《法华经玄赞》、五代前蜀天复二年的血书《观音经》等都是遗书中的精品。第五单元展现了一个世纪以来国内外敦煌学者在敦煌遗书、敦煌艺术等领域进行的广泛而深入的研究及取得的丰硕成果。一批中外学术著作充分反映了“敦煌在中国，敦煌学在世界”的盛况。